Les organes de la fondation sont le Conseil de fondation et la direction de l’Institut.
Le Conseil de fondation est composé de personnalités indépendantes. Le Conseil oeuvre à promouvoir l’Institut, défendre ses intérêts et veiller à son rayonnement. Il définit également les orientations stratégiques de celui-ci.
L’Institut est placé sous la responsabilité d’un directeur qui a la charge des affaires académiques, de la gestion administrative et financière ainsi que du développement de l’Institut.
Le directeur de l’Institut est secondé par la Direction académique et la Direction exécutive.